TÉCNICAS CONVENCIONALES Y MOLECULARES
EN LA IDENTIFICACIÓN DE HONGOS
MICROSCÓPICOS DE IMPORTANCIA MÉDICA.
REVISIÓN SISTEMÁTICA
CONVENTIONAL AND MOLECULAR TECHNIQUES FOR
THE IDENTIFICATION OF MICROSCOPIC FUNGI OF
MEDICAL IMPORTANCE. A SYSTEMATIC REVIEW
Maria del Sagrario Juárez Hernández
Universidad Juárez Autónoma de Tabasco, México
Candelario Rodríguez Pérez
Universidad Juárez Autónoma de Tabasco, México
Santa Dolores Carreño Ruiz
Universidad Autonóma de Chiapas, México
Luis Daniel Jiménez Martínez
Universidad Juárez Autónoma de Tabasco, México
Rosa Felicita Ortiz Ojeda
Universidad Juárez Autónoma de Tabasco, México
pág. 6759
DOI: https://doi.org/10.37811/cl_rcm.v8i6.15362
Técnicas Convencionales y Moleculares en la Identificación de Hongos
Microscópicos de Importancia Médica. Revisión Sistemática
Maria del Sagrario Juárez Hernández
1
sagrariojuarezhernandez@gmail.com
https://orcid.org/0009-0001-8312-5743
Universidad Juárez Autónoma de Tabasco
México
Candelario Rodríguez Pérez
potencia_rguez@hotmail.com
https://orcid.org/0000-0002-8233-0577
Universidad Juárez Autónoma de Tabasco
México
Santa Dolores Carreño Ruiz
lasanta456@hotmail.com
https://orcid.org/0000-0002-5782-193X
Universidad Autonóma de Chiapas
México
Luis Daniel Jiménez Martínez
luisd1984@hotmail.com
https://orcid.org/0000-0001-6304-5669
Universidad Juárez Autónoma de Tabasco
México
Rosa Felicita Ortiz Ojeda
rosaf_oo@hotmail.com
https://orcid.org/0000-0001-9137-7118
Universidad Juárez Autónoma de Tabasco
México
RESUMEN
Esta revisión tuvo como objetivo analizar las diferentes técnicas en la identificación de hongos
microscópicos con importancia médica. El estudio se llevó a cabo bajo la metodología PRISMA, lo que
aseguró una squeda de artículos científicos de forma sistemática y exhaustiva. Los resultados
muestran que los cultivos y las tinciones son métodos de identificación que se utilizan de primera
instancia, pero presentan limitaciones como el tiempo y la precisión en el reporte lo cual es importante
y más cuando se presenta en pacientes con estado crítico. Sin embargo, las técnicas moleculares en
particular las PCR y sus variantes como tiempo real y multiplex permiten un diagnóstico más oportuno
y certero debido a que son más precisos y sensibles, además de que acortan el tiempo de respuesta. Por
otro lado, se encontró que la combinación de los métodos de identificación muestra resultados
adecuados en el diagnóstico de enfermedades como la aspergilosis y la candidiasis dando mayor
atención en el tratamiento. En conclusión, las herramientas moleculares deben incorporarse a los
laboratorios clínicos para mejorar la eficacia en la identificación de infecciones por agentes fúngicos.
Palabras claves: hongos microscópicos, diagnósticos, técnicas moleculares, técnica convencional
1
Autor principal.
Correspondencia: potencia_rguez@hotmail.com
pág. 6760
Conventional and Molecular Techniques for the Identification of
Microscopic Fungi of Medical Importance. A Systematic Review
ABSTRACT
This review aimed to analyze the different techniques for identifying microscopic fungi with medical
importance. The study was carried out using the PRISMA methodology, which ensured a systematic
and exhaustive search for scientific articles. The results show that cultures and stains are identification
methods that are used as a first-line method, but they have limitations such as time and accuracy in
reporting, which is important and even more so when it occurs in patients in critical condition. However,
molecular techniques, particularly PCR and its variants such as real-time and multiplex, allow for a
more timely and accurate diagnosis because they are more precise and sensitive, and also shorten the
response time. On the other hand, it was found that the combination of identification methods shows
adequate results in the diagnosis of diseases such as aspergillosis and candidiasis, giving greater
attention to treatment. In conclusion, molecular tools should be incorporated into clinical laboratories
to improve the effectiveness of identifying fungal infections.
Keywords: microscopic fungi, diagnostics, molecular techniques, conventional technique
Artículo recibido 28 noviembre 2024
Aceptado para publicación: 20 diciembre 2024
pág. 6761
INTRODUCCIÓN
La identificación de hongos microscópicos es una base fundamental que cobra importancia en la
micología médica, debido a que permite diagnosticar de manera precisa y oportuna las infecciones
fúngicas y de esta manera establecer tratamientos efectivos (Jillwin et al., 2021). Las afecciones
provocadas por los agentes fúngicos pueden ir variando de diferentes formas, ya sean superficiales
como las infecciones de la piel y de mucosas así como aquellas infecciones invasivas, que provocan
porcentajes de mortalidad que van de 40 % a 90 % en pacientes inmunocomprometidos (Sabino et al.,
2020). Debido a que de forma global existe un aumento de infecciones por hongos microscópicos que
se relacionan con diferentes enfermedades como el cáncer, la diabetes y la inmunosupresión asociada a
trasplantes o tratamientos con quimioterapia, se hace crítico la necesidad de realizar un diagnóstico
temprano y efectivo.
Históricamente los métodos fenotípicos tradicionales, se han considerado el estándar de oro (Kung
et al., 2018) en las pruebas de identificación de agentes fúngicos. Dentro de estos métodos están
incluidos las técnicas como cultivos, tinciones y pruebas bioquímicas, que proporcionan características
como la morfología, el metabolismo y crecimiento de los microorganismo (Marin et al., 2023). Aunque,
estos métodos parecen tener relevancia presentan ciertas limitaciones que son significativas, por
ejemplo, el tiempo de respuestas, que en ocasiones pueden ser prolongados debido a que los cultivos
oscilan entre 3 y 14 días en poder brindar información definitiva y al ser tardado su desarrollo
incrementa el costo para su identificación (Chuku, 2018). Por otro lado, se encuentra la falsa
negatividad, que se presenta cuando las muestras contienen una baja viabilidad del microorganismo y
se requiere de muestras clínicas representativas y abundantes para poder observar las estructuras
características de los agentes infecciosos (Fernández et al., 2023) y si no se obtiene puede resultar como
negativo, incluso en presencia de una infección activa (Kung et al., 2018). De igual forma, otra limitante
es la falta de especificidad, esto ocurre cuando son varias las especies fúngicas (Mellado, 2020) y dentro
de ellas comparten morfologías similares, por lo tanto se hace difícil la identificación a nivel de género
o especie (Hafirassou et al., 2017). La rinosinusitis fúngica, es un ejemplo claro de que se tiene que
diferenciar la especie entre Aspergillus y Mucorales puesto que sus comportamientos patológicos son
distintos, y por lo tanto es crucial en sus tratamientos.
pág. 6762
Sin embargo, en las primeras etapas de la infección se hace difícil detectar la especies, usando métodos
tradicionales (Zhao et al., 2011). Otras infecciones como la aspergilosis invasiva y la candidemia, son
ejemplos particulares del desafío que presentan estos métodos en el diagnóstico de la enfermedad. Por
su parte, en la identificación del agente causante de la aspergilosis, en los cultivos tradicionales se ha
observado que tienen una sensibilidad del 25% al 50%, en tanto, con el uso de técnicas moleculares
como la PCR en la identificación ha demostrado porcentajes superiores al 90% (Sabino et al., 2020).
De igual forma, la candidemia, que es una de las infecciones por hongos y comunes en los espacios
hospitalarios, se ha detectado con la PCR por tiempos menores a 24 horas, a diferencia de los 2 a 7 días
que los hemocultivos tardan en arrojar los resultados (Taira et al., 2014).
Los avances en el uso de las técnicas moleculares han venido desarrollándose desde la década de 1990,
y se han utilizado en el diagnóstico de las enfermedades causado por hongos microscópicos. Dentro de
estas técnicas se encuentra la PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa, por sus siglas en ingles), que
ha sido una de las más utilizadas porque presenta una alta sensibilidad y tiene la capacidad de amplificar
grandes cantidades de ADN fúngico con mayor precisión y sensibilidad (Kordalewska & Perlin, 2019)
en muestras clínicas (Arvanitis et al., 2014).
Con el paso del tiempo esta técnica fue evolucionando, en otras variantes avanzadas como la PCR en
tiempo real (qPCR) (İlhan et al., 2023), la PCR multiplex y la PCR panfungal, cada una con aplicaciones
específicas para la detección y cuantificación de hongos en diferentes contextos clínicos (Fuchs et al.,
2019). Reduciendo el tiempo de respuesta, tal es caso de estudios realizados en Argentina, donde el
tiempo de respuesta fue de cuatro días en comparación a los 19 as con el cultivo sanguíneo (Marin
et al., 2023), así como en la obtención de resultados de cuatro semanas a siete horas (Álvarez-Mosquera
et al., 2018), y otras en tres horas, demostrando con ello su eficacia en la identificación de especies
fúngicas microscópicas (Y et al., 2010) que otros medios convencionales hacen difícil la diferenciación
de las especies (Zaidan & Hadeel, 2014).
Otro de los avances, en esta técnica y que ha ampliado las posibilidades de la identificación de hongos,
es la secuenciación de nueva generación (NGS) con esta se ha podido diagnosticar enfermedades a
través del análisis completo del genoma de las especies (Wijendra et al., 2024) que se encuentran en las
muestras de los pacientes; esta tecnología no solo identifica especies raras o emergentes, también
pág. 6763
detecta mutaciones que se encuentran asociadas con resistencia fúngica. Tal es el caso de mutaciones
como las del gen CYP51A del Aspergillus fumigatus, que se ha documentado que se encuentra asociado
con la resistencia a fármacos como los azoles (Faria-Gonçalves et al., 2021) que tiene propiedades de
inhibición e impiden que algunas enzimas se unan al ergosterol y por lo tanto alteran la estructura y el
funcionamiento de la pared celular de los hongos (Sabino et al., 2020). Con esta técnica, se optimiza el
tiempo del diagnóstico, además, de que se focaliza el tratamiento personalizado de infecciones críticas,
mejorado el estado de los pacientes.
Dentro de las aplicaciones clínicas, las técnicas moleculares, se han visto que particularmente tienen
utilidad en la diagnosis de las infecciones por agentes fúngicos. Por ejemplo, en el diagnóstico de la
candidemia en pacientes pediátricos, se observó que, la PCR multiplex detectó infecciones en el 24%
de los casos, en comparación de los 14,8% que fue identificado utilizando medios de cultivos
tradicionales (Taira et al., 2014). Estos porcentajes marcan la diferencia y son cruciales cuando se
requiere un diagnóstico temprano para reducir de manera significativa la mortalidad asociada, por lo
que, identificar las especies causantes puede mejorar potencialmente la calidad de la atención y
disminuir la mortalidad humana (Busser et al., 2020).
Hablando de las infecciones cutáneas y ungueales, como la onicomicosis, se ha observado que la PCR
en tiempo real, presenta superioridad ante métodos tradicionales como la microscopía y los cultivos,
llegando a obtener porcentajes de sensibilidad de 87 % frente a los 47 % que presentan los métodos de
cultivos (Gong et al., 2016). Esta técnica es esencial para el diagnóstico temprano, debido a que
proporcionan resultados rápidos y específicos, además, de demostrar ser efectiva inclusive cuando la
carga fúngica es baja (Hafirassou et al., 2017). Por otro lado, se ha encontrado estudios que usan la
combinación de los métodos moleculares y tradicionales (Zhao et al., 2011) para ofrecer un enfoque
más completo en el diagnóstico de las enfermedades; encontrándose coincidencia en la identificación
de ambos métodos (Asadzadeh et al., 2019). Por ejemplo, el uso en conjunto de la PCR con los cultivos
selectivos como CHROMagar mejoran la sensibilidad y especificidad al diagnosticar infecciones
causada por Candida albicans (Ali et al., 2015) y otras especies (Estrada-Barraza et al., 2011).
La adopción de las herramientas moleculares en los estudios de identificación de patógenos fúngicos,
presenta desafíos que tiene que ver con los costos del equipo y los reactivos que se necesitan para poder
pág. 6764
implementar las técnicas de PCR y NGS, debido a que son significativamente más elevados los precios
que los métodos tradicionales (Mahmoudi Rad et al., 2012). Por otro lado, el grado de complejidad en
las técnicas, hace que se requiera personal que cuente con conocimiento en biología molecular, para la
interpretación de los resultados (Morales Restrepo et al., 2018), por lo que los laboratorios con recursos
restringidos se ven limitados. Es por ello, que todavía se encuentran regiones que siguen diagnosticando
las infecciones fúngicas, utilizando los métodos tradicionales como su única opción viable.
A pesar, del uso de las técnicas moleculares en la micología clínica, se espera que se vallan integrando
más herramientas que permitan una integración de estos en los laboratorios clínicos, con equipos más
accesibles y automatizados, pero con costos reducidos que permitan una adopción más amplia, como la
combinación de herramientas de NGS y la inteligencia artificial para mejorar la capacidad de los
laboratorios en la identificación de patógenos emergentes y poder predecir patrones de resistencia
antifúngica (Lockhart et al., 2017). Es por ello que el objetivo de esta investigación es mostrar las
diferentes técnicas que se utilizan en la identificación de hongos microscópicos con importancia médica.
METODOLOGÍA
Para la realización del estudio se llevó a cabo una búsqueda de artículos científicos de forma sistemática
y exhaustiva bajo el método PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-
Analyses) con la finalidad de precisar las técnicas convencionales y moleculares que están determinadas
en las literaturas y que se utilizan para diagnosticar enfermedades relacionadas con los hongos
microscópicos. Para la identificación de la literatura se utilizó motores de búsqueda tales como Ebsco,
Google Académico y PubMed, debido a que estas bases de datos contienen información con artículos
publicados de interés.
Las palabras claves que se utilizaron para búsqueda fueron “hongos microscópicos”, “diagnóstico”,
“técnicas moleculares”, “técnica convencional”. Para filtrar la información se tomó en cuenta el idioma
por lo que se trabajó con documentos publicados en español e inglés.
Criterios de selección
Todos los artículos que identificaban hongos microscópicos a través de técnicas y herramientas
moleculares fueron seleccionados. La selección se centró en la relación con los siguientes: (1) el estudio
investigó las técnica y herramientas en la identificación de hongos microscópicos de importancia
pág. 6765
médica; (2) estudios con pacientes diagnosticados con alguna enfermedades por hongos microscópicos;
(3) todos aquellos documentos que implementaron técnicas moleculares para identificar el agente
causante de la enfermedad; (4) y que además, fueron publicados dentro del periodo de años 2010 al
2023. Los criterios de exclusión fueron: (1) artículos cuyo análisis no correspondieron a la búsqueda de
interés; (2) publicados en fecha anterior al año 2010; (3) artículos duplicados; (4) artículos de revisión,
meta-análisis, o artículos con solamente resumen.
Extracción de datos
Para asegurar la exactitud de la información, la extracción de los datos fue realizada de forma
independiente por dos autores (CRP y MSJH) sobre la base de un protocolo estándar que incluye los
siguientes elementos: apellido del primer autor, el año de publicación del artículo, la ubicación
geográfica, el diagnostico, diseño de estudio, el número total de la muestra, genero, promedio de edad,
y método de identificación.
RESULTADOS
Al realizar la búsqueda en las tres bases de datos se encontró un total de 571 artículos que estaban
relacionados con la investigación. En PubMed se registró 262, en Google Académico 100 y en EBSCO
209 artículos. En cada motor de búsqueda se aplicaron los criterios de selección previamente descritos,
obteniendo de esta manera un total de 218 artículos.
Al revisar todos los artículos se consideraron 43 documentos duplicados en las diferentes bases por lo
cual fueron eliminados, quedando un total de 175. Posteriormente, se les aplicó los criterios necesarios
de inclusión donde se analizó, si los estudios trataban de investigaciones que tenían que ver con
diagnóstico de enfermedades por hongos microscópicos, descartando de esta manera 27 investigaciones
por tratarse de meta-análisis y revisiones, quedando 148 documentos, de ello 130 fueron excluidos por
no presentar en su metodología técnicas y herramientas moleculares en la identificación, además de
estar fuera del rango de años previamente descrito para el análisis. Por lo que la revisión del estudio
comprendió un total de 18 artículos que fueron validados para extraer la información. (Figura 1).
Del total de artículos seleccionados el 40% correspondió a la base de datos PubMed; el 33,3% a EBSCO
y el 26,7% a Google Académico. En cuanto a la distribución de los estudios analizados se encontraron
trabajos de cuatro continentes, uno Africano, tres Asiáticos, cinco Europeos y seis del continente
pág. 6766
Americano. Por otro lado, se observó que por año hubo un reporte de estudio y solo en los años 2013 y
2022 no se encontró estudio alguno. Se observó diferentes patologías asociado con la presencia de
hongos microscópicos y dentro de estas enfermedades, la candidiasis vaginal y vulvovaginal se
investigaron en Irak, Irán y Portugal utilizando variantes de la PCR así como métodos convencionales
en la identificación.
En Perú y Portugal la Aspergilosis invasiva fue estudiada en el 2019 y 2020 respectivamente, el primer
estudio con PCR en tiempo real y el segundo combinó los métodos convencional y molecular para la
tipificación. Tabla1. En la misma tabla se encontró que en la población del estudio predominó el grupo
de las mujeres con el 65,5% (856) con respecto a los hombres con el 34,5% (451).
Figura 1. Flujograma de la selección de los artículos en el estudio
En la gráfica 1, se puede observar los porcentajes de las diferentes técnicas y herramientas moleculares
utilizadas en la identificación de hongos microscópicos de los diferentes estudios. El 55 % de los
trabajos, utilizaron métodos moleculares en sus diferentes variantes, mientras que los métodos
convencionales se presentaron en el 45 %. De forma particular, tanto el cultivo como la PCR
convencional se utilizaron en el 15 % de los estudios.
pág. 6767
Tabla 1. Características individuales de los estudios incluidos en la revisión
Autor
Año
País
Material
biológico
Método de
identificación
n
Género
x
Edad
n° de
especie
H/M
Y, N.
2010
Irlanda
Esputo
Cultivo
convencional,
Cultivo micológico,
PCR, secuenciación
77
37/40
28,5
107
Zhao, Z.
2011
China
Tejido
PCR/RLB
60
/
/
98
Estrada, B.
D.
2011
México
Mucosa oral,
Expectoraciones
CHROMagar, Agar
harina de maíz, PCR
/
/
/
79
Mahmoudi,
Rad
2012
Irán
Muestra vaginal
PCR Multiplex
175
0/175
32,4
191
Zaidan, K. l
2014
Irak
Muestra vaginal
PCR, RAPD-PCR,
CHROMagar
105
0/105
30,5
122
Taira, C. L.
2014
Brasil
Sangre
Hemocultivo, PCR
anidada múltiple
54
33/22
18
meses
/
Ali, A.
2015
Irak
Oral, Vaginal,
Orina, Cutánea,
Uñas
CHROMagar, PCR
108
/
/
57
Gong, J.
2016
China
Uñas
Microscopía,
Cultivo, PCR
convencional, PCR
tiempo real
165
/
/
49
Kung, V. L.
2017
EUA
Quirúrgicas y
citológicas
Microscopía
3164
/
/
333
Hafirassou,
A. Z.
2017
Argelia
Uñas
RT-PCR,
Microscopía
70
/
/
51
Álvarez, M.
I.
2018
España
Escamas de
pies, uñas,
cabello
Cultivo,
Microscopía, PCR
626
200/426
51,33
211
Béjar, V.
2019
Perú
Tejido
pulmonar,
Esputo,
Aspirado
bronquial
PCR tiempo real
20
/
/
10
Fuchs, S
2019
Austria
Sangre
Hemocultivo, PCR
Fungiplex (FP) y
PCR SeptiFast (SF)
54
32/22
61,8
18
Sabino, R.
2020
Portugal
Nariz, Tejido
óseo, Tejido de
cerebro
PCR multiplex, PCR
panfungal, cultivo
4
3/1
45,75
5
Faria, G. P.
2021
Portugal
Muestra vaginal
Perfil bioquímico,
RAPD/PCR
15
0/17
/
62
Marín, E.
2023
Argentina
Orina y Sangre
PCR anidada HC-
Ag
116
83/33
42,0
/
İlhan, B.
2023
Turquía
Biopsia oral
PCR tiempo real
80
46/34
61,07
130
Fernández,
N. B.
2023
Argentina,
Paraguay,
Bolivia y
Perú
Mucosa oral,
nasal, Laringe,
Piel
Microscopía, PCR
anidada
19
17/2
53,0
14
Fuente directa
pág. 6768
Grafica 1. Técnicas convencionales y moleculares utilizadas en el diagnóstico de enfermedades por
hongos
Fuente directa
En la tabla 2, se reporta que de 102 muestras analizadas en el estudio se identificó un total de 25 géneros
con 52 especies fúngicas de relevancia clínica. El género que mayormente se presentó fue Candida con
el 51,05%, dentro de ello, la especie albicans fue la más prevalente, con 10,87 % del total de las
especies, subrayando su importancia particularmente en infecciones fúngicas. Por otro lado, especies
de como glabrata, krusei, parapsilosis y tropicalis, también mostraron una prevalencia notable, del
6,86 % cada una evidenciándose en el contexto clínico, la diversidad de especies dentro de este género.
Por otra parte, también se destaca la presencia de otros géneros como el Aspergillus, que mostró
prevalencia del 12,74 %, siendo la especie fumigatus la que más presencia tuvo con un 6,86 %; mientras
que los géneros como Trichophyton y Mucor tienen una presencia menos frecuente pero relevante,
indicando su participación en infecciones específicas o en pacientes con condiciones subyacentes.
15.0%
2.5%
7.5%
2.5%
2.5%
12.5%
2.5%
15.0%
2.5%
5.0%
5.0%
7.5%
10.0%
2.5%
2.5%
2.5%
2.5%
Cultivo convencional
Harina de Maiz
CHROMagar
Perfil bioquímico
Cultivo micológico
Microscopía
HC-Ag
PCR convencional
PCR/RLB
PCR Multiplex
RAPD-PCR
PCR anidada
PCR tiempo real
PCR Fungiplex (FP)
PCR SeptiFast (SF)
PCR panfungal
Secuenciación
Porcentaje
Tecnica convencional y molecular
pág. 6769
Tabla 2. Especies de hongos microscópicos identificados en los estudios
Fuente directa
id
Cantidad
Especie
%
Especie
%
Género
id
Cantidad
Especie
%
Especie
%
Genero
1
1
Absidia corymbifera
0,98
0,96
28
1
Geotrichum capitatum
0,98
0,96
2
1
Acremonium strictum
0,98
0,96
29
1
Histoplasma spp
0,98
1,96
3
1
Aspergillus niger
0,98
12,74
30
1
Histoplasma capsulatum
0,98
4
1
Aspergillus terreus
0,98
31
1
Malassezia spp
0,98
0,96
5
1
Aspergillus flavus
0,98
32
1
Mucor cercinelloidea
0,98
3,92
6
7
Aspergillus fumigatus
6,86
33
1
Mucor heimalis
0,98
7
1
Aspergillus nidulans
0,98
34
1
Mucor racemosus
0,98
8
1
Aspergillus spp
0,98
35
1
Mucorales
0,98
9
1
Aspergillus versicolor
0,98
36
1
Penicillium spp
0,98
0,96
1
0
11
Candida albicans
10,87
51,05
37
1
Pneumocystis jirovecii
0,98
0,96
1
1
3
Candida dubliniensis
2,94
38
1
Rhi-zomucor pusillus
0,98
0,96
1
2
7
Candida glabrata
6,86
39
1
Rhizopus arrhizus
0,98
1,96
1
3
3
Candida guillier-mondii
2,94
40
1
Rhizopus microsporus
0,98
1
4
1
Candida kefyr
0,98
41
1
Rhodotorula
mucilaginosa
0,98
0,96
1
5
7
Candida krusei
6,86
42
2
Saccharomyces
cerevisiae
1,96
1,92
1
6
2
Candida lusitaniae
1,96
43
1
Scedosporium
apiospermum
0,98
0,96
1
7
7
Candida parapsilosis
6,86
44
1
Scopulariopsis
brevicaulis
0.98
0,96
1
8
1
Candida pelliculosa
0,98
45
1
Paracoccidioides spp
0,98
0,96
1
9
1
Candida pulcherrima
0,98
46
1
Thanatephorus
cucumeris,
0,98
0,96
2
0
2
Candida spp
1,96
47
3
Trichophyton rubrom
2,94
7,84
2
1
7
Candida tropicalis
6,86
48
1
Trichophyton
interdigitale
0,98
2
2
1
Cladosporium spp.
0,98
0,96
49
1
Trichophyton
interdigitale
0,98
2
3
1
Criptococo neoformans
0,98
0,96
50
1
Trichophyton spp
0,98
2
4
1
Dermatofitos
0,98
0,96
51
1
Trichophyton tonsurans
0,98
2
5
1
Exophiala ( Wangiella )
dermatitidis
0,98
0,96
52
1
Trichophyton
violanceum
0,98
2
6
2
Fusarium culmorum
1,96
1,92
Total
102
100
2
7
1
Fuscoporia ferrea
0,98
0,96
pág. 6770
DISCUSIÓN
En la identificación de organismos como los hongos microscópicos que tienen importancia medica se
han presentado desafíos que tienen que ver con la limitación de los métodos convencionales. En esta
investigación se vio reflejado la adopción paralela del uso de las técnicas moleculares y métodos
convencionales para la identificación de especies fúngicas. Aunque las herramientas moleculares han
demostrado ser más rápidas y precisas que los métodos fenotípicos tradicionales (Mahmoudi Rad et al.,
2012); (Lockhart et al., 2017);(Fuchs et al., 2019). La PCR y sus variantes, como la qPCR en tiempo
real, han reducido los tiempos de diagnóstico de semanas a horas, optimizando de esta manera el
tratamiento oportuno y favoreciendo los resultados en pacientes críticos (Álvarez-Mosquera et al.,
2018); (Marin et al., 2023).
La detección de los microorganismos patógenos en sus etapas tempranas es favorecido con la precisión
de las técnicas moleculares a diferencia de los métodos convencionales, que se ven limitados por que
requieren de periodos prolongados para el crecimiento, además de abundante muestras clínicas del
agente fúngico (Morales Restrepo et al., 2018); (Fernández et al., 2023). Una identificación rápida y
especifica si hablamos en el contexto de las infecciones invasivas es particularmente relevante porque
pueden ser determinante para reducir la mortalidad asociada (Arvanitis et al., 2014)
En este trabajo de revisión sistemática se mostró que hubo un predominio en el uso las herramientas
moleculares en estudios como la candidiasis y la aspergilosis, en los diferentes países como Irak, Irán,
Perú y Portugal, empleándose la combinación de la PCR con método tradicionales mejorando así, la
especificidad en el diagnóstico (Béjar et al., 2019); (Zaidan & Hadeel, 2014). Ahora bien, en cuanto a
prevalencias en las especies, se identificó que Candida albicans y Aspergillus fumigatus son las que
mayormente se presentaron en los estudios, confirmándose de esta manera la importancia clínica de
estos y la necesidad de técnicas y/o herramientas que permitan la rápida identificación y oportuna
diferenciación dentro de los géneros (Marin et al., 2023);(Estrada-Barraza et al., 2011). Por otra parte,
cultivos selectivos como CHROMagar, son básicos y útiles en la identificación preliminar, pero las
técnicas moleculares son necesarias para reafirmar el diagnóstico en los pacientes con infecciones
graves o comorbilidades que pueden afectar el sistema inmune (Guzmán D, 2004); (Hafirassou et al.,
2017).
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Con los resultados encontrados, se sugiere que a pesar de que los métodos convencionales siguen
teniendo una participación importante en la identificación de hongos patógenos, la combinación con
herramientas moleculares prometen un diagnóstico mucho más completo y efectivo (Chuku, 2018). De
igual forma, en esta investigación se destaca que aunque los costos son altos para adoptar las técnicas
moleculares, esto se traduce en mayor precisión y rapidez en el diagnóstico, lo que es crucial en el
tratamiento de infecciones fúngicas invasiva. Al integrar estas herramientas en los laboratorios clínicos
va a permitir afrontar mejor la diversidad hongos patógenos emergentes (Faria-Gonçalves et al., 2021)
CONCLUSION
En esta revisión sistemática se puede apreciar que la identificación de hongos de importancia médica a
través de herramientas moleculares presenta avances significativos en contraste con los métodos
tradicionales. Las técnicas convencionales como los cultivos y las tinciones en primera instancia son
esenciales en la identificación del patógeno, sin embargo, presentan limitaciones como la rapidez y la
precisión. Las técnicas de PCR en sus diferentes variantes, son las más rápidas y precisas. Además la
combinación de estos métodos de identificación representa una estrategia más certera al diagnosticar
las enfermedades causados por hongos. Por ello es necesario integrar estos métodos en el diagnostico
micológico en la identificación de infecciones fúngicas invasivas.
REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS
Ali, A., Al-Attraqhchi, A., & Alahmer, S. (2015). Molecular detection of ALS1 virulence gene of
Candida albicans isolated from groups of Iraqi patients. Journal of the Faculty of Medicine-
Baghdad, 57, 79-83. https://doi.org/10.32007/med.1936/jfacmedbagdad.v57i1.18
Álvarez-Mosquera, I., Hernáez, S., Sánchez, J., Suárez, M., & Cisterna Cancer, R. (2018). Diagnosis of
Superficial Mycoses by a Rapid and Effective PCR Method from Samples of Scales, Nails and
Hair. Mycopathologia, 183, 1-7. https://doi.org/10.1007/s11046-018-0290-5
Arvanitis, M., Anagnostou, T., Fuchs, B. B., Caliendo, A. M., & Mylonakis, E. (2014). Molecular and
Nonmolecular Diagnostic Methods for Invasive Fungal Infections. Clinical Microbiology
Reviews, 27(3), 490-526. https://doi.org/10.1128/cmr.00091-13
pág. 6772
Asadzadeh, M., Alanazi, A. F., Ahmad, S., Al-Sweih, N., & Khan, Z. (2019). Lack of detection of
Candida nivariensis and Candida bracarensis among 440 clinical Candida glabrata sensu lato
isolates in Kuwait. PloS One, 14(10), e0223920. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0223920
Béjar, V., Villanueva, F., León, S. R., Guevara-Granados, J. M., Uribe, A., Vergaray, G., Cuadra, A., &
Sabogal, I. (2019). Identificación molecular de Aspergillus fumigatus aislados de pacientes con
aspergilosis invasiva. Revista Peruana de Medicina Experimental y Salud Pública, 36(1), 81.
https://doi.org/10.17843/rpmesp.2019.361.3403
Busser, F. D., Coelho, V. C., Fonseca, C. de A., Del Negro, G. M. B., Shikanai-Yasuda, M. A., Lopes,
M. H., Magri, M. M. C., & Freitas, V. L. T. de. (2020). A Real Time PCR strategy for the
detection and quantification of Candida albicans in human blood. Revista Do Instituto De
Medicina Tropical De Sao Paulo, 62, e9. https://doi.org/10.1590/S1678-9946202062009
Chuku, A. (2018). Effective Diagnostic Techniques in the Identification of Medically Important Fungi:
A Developing World Perspective. Annual Research & Review in Biology, 28(4), 1-9.
https://doi.org/10.9734/ARRB/2018/43123
Estrada-Barraza, D., Dávalos Martínez, A., Flores-Padilla, L., Mendoza-De Elias, R., & Sánchez-
Vargas, L. O. (2011). Comparación entre métodos convencionales, ChromAgar Candida® y el
método de la PCR para la identificación de especies de Candida en aislamientos clínicos.
Revista Iberoamericana de Micología, 28(1), 36-42.
https://doi.org/10.1016/j.riam.2010.11.003
Faria-Gonçalves, P., Gaspar, C., Oliveira, A. S., Palmeira-de-Oliveira, R., Gonçalves, T., Martinez-de-
Oliveira, J., Palmeira-de-Oliveira, A., & Rolo, J. (2021). Evaluation of overtime phenotypic
variation of yeasts in chronic vulvovaginal candidosis cases. Medical Mycology, 59(12), 1166-
1173. https://doi.org/10.1093/mmy/myab048
Fernández, N. B., Toranzo, A., Farias, L., & Canteros, C. E. (2023). Diagnóstico micológico de
paracoccidioidomicosis en un hospital de área no endémica: Metodología clásica y molecular.
Biomédica, 43(Sp. 1), 132-143. https://doi.org/10.7705/biomedica.6888
pág. 6773
Fuchs, S., Lass-Flörl, C., & Posch, W. (2019). Diagnostic Performance of a Novel Multiplex PCR Assay
for Candidemia among ICU Patients. Journal of Fungi (Basel, Switzerland), 5(3), 86.
https://doi.org/10.3390/jof5030086
Gong, J., Ran, M., Wang, X., Wan, Z., & Li, R. (2016). Development and Evaluation of a Novel Real-
Time PCR for Pan-Dermatophyte Detection in Nail Specimens. Mycopathologia, 1-2(181), 51-
57. https://doi.org/10.1007/s11046-015-9915-0
Guzmán D, A. M. (2004). Importancia del laboratorio en el diagnóstico de las micosis invasoras. Revista
chilena de infectología, 21(1). https://doi.org/10.4067/S0716-10182004000100005
Hafirassou, A. Z., Valero, C., Gassem, N., Mihoubi, I., & Buitrago, M. J. (2017). Usefulness of
techniques based on real time PCR for the identification of onychomycosis-causing species.
Mycoses, 60(10), 638-644. https://doi.org/10.1111/myc.12629
İlhan, B., Vural, C., Gürhan, C., Vural, C., Veral, A., Wilder-Smith, P., Özdemir, G., & Güneri, P. (2023).
Real-Time PCR Detection of Candida Species in Biopsy Samples from Non-Smokers with Oral
Dysplasia and Oral Squamous Cell Cancer: A Retrospective Archive Study. Cancers, 15(21),
5251. https://doi.org/10.3390/cancers15215251
Jillwin, J., Rudramurthy, S. M., Singh, S., Bal, A., Das, A., Radotra, B., Prakash, H., Dhaliwal, M.,
Kaur, H., Ghosh, A. K., & Chakrabarti, A. (2021). Molecular identification of pathogenic fungi
in formalin-fixed and paraffin-embedded tissues. Journal of Medical Microbiology, 70(2),
001282. https://doi.org/10.1099/jmm.0.001282
Kordalewska, M., & Perlin, D. S. (2019). Identification of Drug Resistant Candida auris. Frontiers in
Microbiology, 10. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.01918
Kung, V. L., Chernock, R. D., & Burnham, C. -a. D. (2018). Diagnostic accuracy of fungal identification
in histopathology and cytopathology specimens. European Journal of Clinical Microbiology &
Infectious Diseases: Official Publication of the European Society of Clinical Microbiology,
37(1), 157-165. https://doi.org/10.1007/s10096-017-3116-3
Lockhart, S. R., Etienne, K. A., Vallabhaneni, S., Farooqi, J., Chowdhary, A., Govender, N. P., Colombo,
A. L., Calvo, B., Cuomo, C. A., Desjardins, C. A., Berkow, E. L., Castanheira, M., Magobo, R.
E., Jabeen, K., Asghar, R. J., Meis, J. F., Jackson, B., Chiller, T., & Litvintseva, A. P. (2017).
pág. 6774
Simultaneous Emergence of Multidrug-Resistant Candida auris on 3 Continents Confirmed by
Whole-Genome Sequencing and Epidemiological Analyses. Clinical Infectious Diseases: An
Official Publication of the Infectious Diseases Society of America, 64(2), 134-140.
https://doi.org/10.1093/cid/ciw691
Mahmoudi Rad, M., Zafarghandi, A. S., Amel Zabihi, M., Tavallaee, M., & Mirdamadi, Y. (2012).
Identification of Candida Species Associated with Vulvovaginal Candidiasis by Multiplex PCR.
Infectious Diseases in Obstetrics and Gynecology, 2012(1), 872169.
https://doi.org/10.1155/2012/872169
Marin, E., Messina, F. A., Romero, M., Arechavala, A., Negroni, R., Depardo, R., & Santiso, G. (2023).
Evaluation of an enzyme immunoassay technique on detecting urinary Histoplasma capsulatum
antigen in the diagnosis of disseminated histoplasmosis in Argentina. Medicina, 83(6), 863-
874.
Mellado, O. M. D. (2020). 5. Técnicas de biología molecular en el diagnóstico de enfermedades
infecciosas.
Morales Restrepo, N., Cardona-Castro, N., & Universidad CES. (2018). Métodos de diagnóstico en
micología. Ces Medicina, 32(1), 41-52. https://doi.org/10.21615/cesmedicina.32.1.5
Sabino, R., Simões, H., & Veríssimo, C. (2020). Molecular Detection of Aspergillus: Application of a
Real-Time PCR Multiplex Assay in Tissue Samples. Journal of Fungi, 6(1), 11.
https://doi.org/10.3390/jof6010011
Taira, C. L., Okay, T. S., Delgado, A. F., Ceccon, M. E. J. R., Almeida, M. T. G. de, & Negro, G. M. B.
D. (2014). A multiplex nested PCR for the detection and identification of Candida species in
blood samples of critically ill paediatric patients. BMC Infectious Diseases, 14, 406.
https://doi.org/10.1186/1471-2334-14-406
Wijendra, W. A. S., Samarappulige, C. G., Dasanayaka, N., Kaushalya, G., Ramesh, R., & Gunasekara,
S. (2024). Molecular identification and antifungal susceptibility of Candida tropicalis and
Candida parapsilosis isolated from cancer patients. Journal of Experimental and Molecular
Biology, 25(1), Article 1. https://doi.org/10.47743/jemb-2024-108
pág. 6775
Y, N., Js, E., Bc, M., Jm, W., Ce, G., J, R., & Je, M. (2010). Comparison of techniques to examine the
diversity of fungi in adult patients with cystic fibrosis. Medical Mycology, 48(1).
https://doi.org/10.3109/13693780903127506
Zaidan, K. I., & Hadeel, N. A.-S. (2014). Molecular diagnosis of vaginal candidiasis by polymerase
chain reaction (PCR) and random amplification polymorphism DNA (RAPD-PCR) in Babylon
Province, Iraq. African Journal of Microbiology Research, 8(6), 496-502.
https://doi.org/10.5897/AJMR2013.5945
Zhao, Z., Li, L., Wan, Z., Chen, W., Liu, H., & Li, R. (2011). Simultaneous Detection and Identification
of Aspergillus and Mucorales Species in Tissues Collected from Patients with Fungal
Rhinosinusitis. Journal of Clinical Microbiology, 49(4), 1501-1507.
https://doi.org/10.1128/JCM.02262-10