pág. 5065
PERFIL DE SUSCEPTIBILIDAD
ANTIMICROBIANA DE ENTEROCOCCUS SPP.
AISLADOS DE LA MUCOSA RECTAL DE
PERRAS ATENDIDAS EN UNA CLÍNICA
VETERINARIA DEL CANTÓN EL TAMBO
ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBILITY PROFILE OF ENTEROCOCCUS
SPP. ISOLATED FROM THE RECTAL MUCOSA OF FEMALE DOGS
TREATED AT A VETERINARY CLINIC IN THE EL TAMBO CANTON
Darwin Orlando Ortega Nuñez
Universidad Técnica de Machala, Ecuador
Esteban Daniel Caisa Garzón
Universidad Técnica de Machala, Ecuador
Dioselina Esmeralda Pimbosa Ortiz
Universidad Técnica de Machala, Ecuador
pág. 5066
DOI: https://doi.org/10.37811/cl_rcm.v10i1.22610
Perfil de Susceptibilidad Antimicrobiana de Enterococcus spp. aislados de
la Mucosa Rectal de Perras atendidas en una Clínica Veterinaria del
Cantón El Tambo
RESUMEN
Enterococcus spp. forma parte de la microbiota intestinal de los perros; sin embargo, su elevada
capacidad para desarrollar resistencia antimicrobiana ha incrementado su importancia clínica y
epidemiológica. El objetivo del presente estudio fue estimar la prevalencia, caracterizar el perfil de
susceptibilidad antimicrobiana y evaluar su asociación con factores de riesgo en aislamientos de
Enterococcus spp. obtenidos de la microbiota rectal de perras clínicamente sanas atendidas durante una
campaña de esterilización en una clínica veterinaria del cantón El Tambo, Ecuador. Se realizó un estudio
transversal en 33 perras, a partir de las cuales se obtuvieron hisopados rectales. El aislamiento bacteriano
se efectuó mediante cultivo selectivo y la susceptibilidad antimicrobiana se determinó por la técnica de
difusión en agar por discos (Kirby–Bauer). Se aplicó análisis estadístico descriptivo e inferencial para
evaluar asociaciones con factores de riesgo. Se obtuvo crecimiento compatible con Enterococcus spp.
en 30 muestras, correspondiente a una prevalencia del 90,9 %. Los aislamientos mostraron elevados
niveles de resistencia y multirresistencia antimicrobiana, con resistencia generalizada a varios
antibióticos de uso clínico. Se identificó una asociación estadísticamente significativa entre la resistencia
a ciprofloxacina y la permanencia en ambientes con deficiente higiene. Estos resultados evidencian que
perras clínicamente sanas pueden actuar como reservorios de Enterococcus spp. multirresistentes,
resaltando la necesidad de fortalecer la vigilancia antimicrobiana bajo un enfoque de Una Sola Salud.
Palabras clave: Enterococcus spp., resistencia antimicrobiana, microbiota rectal, antibióticos
1
Autor principal
Correspondencia: dortega17@utmachala.edu.ec
Darwin Orlando Ortega Nuñez1
dortega17@utmachala.edu.ec
https://orcid.org/0009-0009-3812-917X
Universidad Técnica de Machala
Ecuador
Esteban Daniel Caisa Garzón
esteban.caisa9@utc.edu.ec
https://orcid.org/0009-0005-2976-3073
Universidad Técnica de Machala
Ecuador
Dioselina Esmeralda Pimbosa Ortiz
dpimbosa@utmachala.edu.ec
https://orcid.org/0000-0001-6146-1845
Universidad Técnica de Machala
Ecuador
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Antimicrobial Susceptibility Profile of Enterococcus spp. Isolated from the
Rectal Mucosa of Female Dogs Treated at a Veterinary Clinic in the El
Tambo Canton
ABSTRACT
Enterococcus spp. is a common component of the canine intestinal microbiota; however, its ability to
develop antimicrobial resistance has increased its clinical and epidemiological relevance. This study
aimed to estimate prevalence, characterize the antimicrobial susceptibility profile, and evaluate
associated risk factors of Enterococcus spp. isolated from the rectal microbiota of clinically healthy
female dogs attending a sterilization campaign at a veterinary clinic in El Tambo canton, Ecuador. A
cross-sectional study was conducted on 33 dogs, from which rectal swabs were collected. Bacterial
isolation was performed using selective culture, and antimicrobial susceptibility was assessed using the
disk diffusion method (Kirby–Bauer). Descriptive and inferential statistical analyses were applied to
evaluate associations with risk factors. Growth compatible with Enterococcus spp. was detected in 30
samples, corresponding to a prevalence of 90.9%. The isolates exhibited high levels of antimicrobial
resistance and multidrug resistance, including resistance to several clinically relevant antibiotics. A
significant association was observed between ciprofloxacin resistance and exposure to poor hygienic
environments. These findings indicate that clinically healthy female dogs may act as reservoirs of
multidrug-resistant Enterococcus spp., highlighting the importance of antimicrobial surveillance within
a One Health framework.
Keywords: Enterococcus spp., antimicrobial resistance, rectal microbiota, antibiotics
Artículo recibido 10 diciembre 2025
Aceptado para publicación: 16 enero 2026
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INTRODUCCIÓN
El género Enterococcus comprende bacterias cocoides Gram positivas, catalasa negativas y anaerobias
facultativas que forman parte habitual de la microbiota intestinal de los animales. Actualmente se
reconocen más de 50 especies dentro del género, de las cuales E. faecalis y E. faecium destacan por su
mayor relevancia clínica y epidemiológica. Aunque inicialmente fueron considerados microorganismos
comensales con escasa importancia patológica, en las últimas décadas han emergido como agentes
oportunistas asociados a infecciones nosocomiales, principalmente debido a su capacidad para
desarrollar resistencia a múltiples antimicrobianos (9,14,22).
Si bien Enterococcus spp. mantiene un papel comensal e incluso probiótico en determinados contextos,
su elevada plasticidad genética le confiere la capacidad de adquirir y diseminar determinantes de
resistencia antimicrobiana. Esta característica ha favorecido su transición desde un microorganismo
principalmente benigno hacia un patógeno oportunista de alto impacto clínico, tanto en medicina
humana como veterinaria (18,28,45).
Aunque Enterococcus spp. rara vez causa enfermedad en individuos inmunocompetentes, se ha
documentado su participación en infecciones del tracto urinario, bacteriemias, endocarditis y afecciones
del sistema nervioso central, especialmente en pacientes inmunocomprometidos. A nivel global, estos
microorganismos se consideran actualmente uno de los principales patógenos implicados en infecciones
asociadas a la atención sanitaria, situación atribuida en gran medida a su resistencia frente a múltiples
antimicrobianos, en particular a la vancomicina, considerada una opción terapéutica de última línea
frente a cepas multirresistentes (5,14,22,30,40).
La transferencia horizontal de genes de resistencia convierte al tracto gastrointestinal en un reservorio
clave para la persistencia y diseminación de cepas resistentes de Enterococcus. Este proceso se ve
influenciado por factores como la abundancia de microorganismos donantes y receptores, el estado
nutricional del huésped y el uso inadecuado de antibióticos con fines terapéuticos o profilácticos. En
este contexto, la infección por enterococos resistentes a vancomicina (VRE) se asocia con un incremento
significativo en las tasas de fracaso terapéutico y mortalidad, que puede oscilar entre el 27 % y el 52 %
(21,40).
pág. 5069
En medicina veterinaria, los animales de compañía han adquirido relevancia como posibles reservorios
de Enterococcus spp. resistentes. Diversos estudios han reportado la presencia de cepas resistentes a
antimicrobianos como ampicilina, fluoroquinolonas, betalactámicos y glucopéptidos en perros y gatos,
lo que plantea un potencial riesgo zoonótico debido al contacto estrecho entre mascotas y humanos
(7,10,11,25,33). Si bien algunos trabajos describen una baja frecuencia de genes de resistencia a
vancomicina, como vanA o vanB, otros han documentado la presencia de E. faecalis resistente a
vancomicina en perros, con prevalencias que pueden alcanzar hasta el 30 % (17,22,37).
La microbiota vaginal y rectal de las perras constituye un nicho ecológico poco explorado desde la
perspectiva de la resistencia antimicrobiana. Si bien se reconoce que Enterococcus spp. forma parte de
la microbiota normal de estas regiones anatómicas, la información disponible sobre su perfil de
susceptibilidad antimicrobiana continúa siendo limitada, especialmente en escenarios clínicos locales
(1,4,23). En Ecuador, y particularmente en el cantón El Tambo, no existen estudios que caractericen
fenotípicamente la resistencia en Enterococcus spp. de la microbiota de perras. Este estudio aportará
datos de línea base esenciales para la vigilancia local y el manejo terapéutico prudente. En este contexto,
el presente estudio tuvo como objetivo evaluar, mediante métodos fenotípicos, la susceptibilidad
antimicrobiana de Enterococcus spp. aislados de hisopados rectales de perras que participaron en una
campaña de esterilización realizada en una clínica veterinaria del cantón El Tambo, así como estimar su
prevalencia y analizar su relación con factores de riesgo relevantes.
MATERIALES Y MÉTODOS
Se realizó un estudio observacional, descriptivo y de corte transversal en perras clínicamente sanas
atendidas durante una campaña de esterilización desarrollada en una clínica veterinaria ubicada en el
cantón El Tambo, provincia del Cañar, Ecuador, durante el mes de junio de 2025. El procesamiento
microbiológico de las muestras se llevó a cabo en el Laboratorio de Microbiología de la Universidad
Técnica de Machala.
La población de estudio estuvo constituida por 33 perras domésticas, las cuales fueron muestreadas una
sola vez durante la atención clínica. No se realizó ninguna intervención experimental ni manipulación
de variables biológicas.
pág. 5070
Toma de muestras
A cada animal se le obtuvo un hisopado rectal, el cual fue colocado en medio de transporte Stuart y
mantenido a 4 °C hasta su procesamiento microbiológico, realizado en un plazo máximo de 24 horas.
Previo a la toma de muestras, los propietarios completaron un formulario destinado a identificar posibles
factores de riesgo asociados a la portación de Enterococcus resistentes, considerando variables como
edad, exposición a antibióticos, contacto con otros caninos y especies animales, contacto con personal
de la salud.
Aislamiento bacteriano y detección de BLEE
Los hisopados rectales pasaron por un proceso de pre-enriquecimiento selectivo con Caldo nutriente al
6,5 % de Cloruro de sodio. Posteriormente mediante estría compuesta se sembraron en placas de agar
Bilis Esculina, medio utilizado para el aislamiento selectivo de Enterococos. Las placas se incubaron a
37 ± 2 °C durante 18–24 h. Las colonias de color negro fueron repicadas en un agar no selectivo para
su posterior análisis fenotípico.
Confirmación bioquímica
Las colonias sospechosas fueron subcultivadas en agar Nutriente y sometidas a tinción de Gram y prueba
de catalasa. Los aislamientos identificados como cocos Gram positivos y reacción negativa a la catalasa
fueron considerados compatibles con Enterococcus spp.
Evaluación del perfil de resistencia antimicrobiana
El perfil de susceptibilidad antimicrobiana se determinó mediante la técnica de difusión en disco (Kirby–
Bauer) en agar Mueller–Hinton, utilizando antimicrobianos de uso frecuente en la práctica veterinaria e
interpretando los resultados según las directrices del CLSI. Se evaluaron norfloxacino (10 µg),
ciprofloxacino (5 µg), eritromicina (15 µg), linezolid (30 µg), penicilina (10 µg), vancomicina (30 µg),
nitrofurantoina (300 µg), amoxicilina (10 µg), minociclina (30 µg), doxiciclina (30 µg), rifampicina (5
µg).
Los aislados se clasificaron como sensibles (S), intermedios (I) o resistentes (R) de acuerdo con los
puntos de corte del CLSI. Tras la confirmación de la especie y del perfil de susceptibilidad, las cepas se
crioconservaron en caldo BHI suplementado con glicerol al 20 % y se almacenaron a −80 °C hasta la
realización de los análisis moleculares.
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Análisis de datos
Los datos obtenidos fueron registrados y organizados en bases manuales y digitales para su análisis. Se
aplicó estadística descriptiva para caracterizar la presencia de Enterococcus spp. y el perfil de
susceptibilidad antimicrobiana, presentando los resultados mediante tablas y representaciones gráficas.
Adicionalmente, se realizó análisis inferencial para evaluar la posible asociación entre el perfil de
susceptibilidad antimicrobiana y los factores de riesgo registrados en las fichas clínicas, empleando
pruebas de asociación (Chi-cuadrado o prueba exacta de Fisher), así como el cálculo de odds ratio (OR)
con sus respectivos intervalos de confianza al 95% (IC95%).
RESULTADOS
De las 33 muestras obtenidas a partir de perras atendidas, se observó crecimiento bacteriano compatible
con Enterococcus spp. en 30 muestras, lo que corresponde a una prevalencia del 90,9 %, resultados que
se presentan en la Tabla 1.
Tabla 1. Resultados del cultivo bacteriano para Enterococcus spp.
Resultado del cultivo
Número de muestras (n)
Porcentaje (%)
Con crecimiento
30
90,90%
Sin crecimiento
3
9,10%
Total
33
100%
Figura 1. Prevalencia de Enteroccus spp. en muestras rectales
30
3
90,9
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
Crecimiento No crecimiento
N muestras %
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En la Tabla 2 se detallan los resultados de la prueba de difusión en agar por discos (Kirby–Bauer) para
cada aislamiento, expresados según la categoría SIR, lo que permite visualizar la variabilidad de
respuesta frente a los antimicrobianos evaluados. En la Figura 2, se observan los halos de inhibición
obtenidos frente a distintos antimicrobianos en un aislamiento compatible con Enterococcus spp.
Figura 2. Halos de inhibición observados en aislamientos de Enterococcus spp. mediante la técnica de
difusión en agar por discos (Kirby–Bauer)
Tabla 2. Perfil individual de susceptibilidad antimicrobiana de los aislamientos de Enterococcus spp.
A
T
B
C
1
C
2
C
3
C
4
C
5
C
6
C
7
C
8
C
9
C
1
0
C
1
1
C
1
2
C
1
3
C
1
4
C
1
5
C
1
6
C
1
7
C
1
8
C
1
9
C
2
0
C
2
1
C
2
2
C
2
3
C
2
4
C
2
5
C
2
7
C
2
8
C
2
9
C
3
0
C
3
1
C
I
P
S
S
S
R
R
R
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R
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S
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P
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S
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V
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I
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R
F
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S
S
S
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S
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R
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R
R
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S
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M
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I
S
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S
S
D
O
R
R
S
R
S
S
R
S
R
R
S
R
I
R
I
R
R
S
R
R
R
R
S
R
R
S
R
S
S
S
pág. 5073
Los aislamientos de Enterococcus spp. evidenciaron variabilidad en su respuesta frente a los
antimicrobianos evaluados, observándose diferencias entre las categorías de susceptibilidad S-I-R. La
distribución de estos resultados por antibiótico se presenta en la Tabla 3, mientras que la Figura 3 facilita
su comparación porcentual entre los distintos agentes antimicrobianos analizados.
Tabla 3. Perfil de susceptibilidad antimicrobiana de Enterococcus spp. (n=30)
ANTIBIÓTICO
SENSIBLE
% (n)
INTERMEDIO %
(n)
RESISTENTE
% (n)
CIP
66,67% (20)
16,6% (5)
16,66% (5)
E
3,33% (1)
0% (0)
96,67% (29)
NOR
90% (27)
0% (0)
10% (3)
LNZ
0% (0)
0% (0)
100% (30)
RA
0% (0)
0% (0)
100% (30)
P
13,33% (4)
0% (0)
86,67% (26)
VA
0% (0)
3,33% (1)
96,67% (29)
F
40% (12)
3,33% (1)
56,67% (17)
AM
6,67% (2)
0% (0)
93,33% (28)
MI
70% (21)
23,33% (7)
6,67% (2)
DO
36,67% (11)
6,67% (2)
56,66% (17)
Figura 3. Distribución porcentual de la susceptibilidad antimicrobiana de los aislamientos de
Enterococcus spp. según clasificación SIR
010 20 30 40 50 60 70 80 90 100
CIP
E
NOR
LNZ
RA
P
VA
F
AM
MI
DO
R (%) I % S (%)
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La multirresistencia antimicrobiana se definió como la resistencia a tres o más familias de antibióticos.
En el presente estudio, el 100% de los aislamientos cumplieron con el criterio de MDR (Tabla 4).
Tabla 4. Multirresistencia antimicrobiana en Enterococcus spp.
Condición
n
%
MDR
30
100%
No MDR
0
0%
En la Tabla 5 se presentan los principales factores de riesgo evaluados en la población canina. Se observó
una alta frecuencia de exposición a determinados factores ambientales y de manejo, los cuales han sido
descritos en la literatura como potencialmente asociados al desarrollo y diseminación de bacterias
resistentes.
Tabla 5. Factores de riesgo en la población estudiada (n= 30)
Factor de riesgo
Frecuencia
Alimenta dieta BARF
29/30 (96,66%)
Uso de antibióticos en los últimos 3
meses
0/30 (0%)
Contacto con otros animales
29/30 (96,66%)
Permanencia en ambientes con
deficiente higiene
10/30 (33,33%)
Contacto con personal de salud
3/30 (10%)
Antecedentes de cuadro clínico
gastrointestinal
0/30 (0%)
Se evaluó la asociación entre los factores de riesgo y la resistencia a antibióticos específicos que
presentaron variabilidad en los resultados. Debido al tamaño muestral y a la distribución de los datos,
se empleó principalmente la prueba exacta de Fisher. Se identificó una asociación estadísticamente
significativa entre la resistencia a ciprofloxacina (CIP) y la permanencia de los animales en ambientes
con deficiente higiene (OR = 12,67; IC95%: 1,18–136,28; p = 0,031). Este resultado sugiere que los
animales expuestos a condiciones higiénicas inadecuadas presentan una mayor probabilidad de albergar
cepas resistentes a este antibiótico.
Otras asociaciones evaluadas no alcanzaron significancia estadística (p > 0,05), aunque algunas
mostraron tendencias que podrían resultar relevantes en estudios con mayor tamaño muestral.
pág. 5075
DISCUSIÓN
La elevada prevalencia de Enterococcus spp. observada en este estudio (90,9 %) confirma su presencia
dominante como componente habitual de la microbiota rectal en perras clínicamente sanas, lo que
concuerda con lo previamente reportado en caninos y otros hospedadores animales. Estos hallazgos
refuerzan el carácter de Enterococcus spp. como colonizador comensal del tracto gastrointestinal, con
potencial comportamiento oportunista bajo determinadas condiciones ambientales o clínicas (7).
A nivel individual, los aislamientos mostraron una marcada heterogeneidad fenotípica en su respuesta
frente a los antimicrobianos evaluados, evidenciada por la variabilidad en las categorías Sensible,
Intermedio y Resistente frente a un mismo antibiótico. Este comportamiento es consistente con estudios
previos que describen la coexistencia de mecanismos de resistencia intrínseca y adquirida en
enterococos de origen animal, favoreciendo perfiles heterogéneos incluso entre cepas aisladas de un
mismo hospedador o población (27,25). El tracto gastrointestinal ha sido descrito como un entorno
favorable para el intercambio horizontal de determinantes de resistencia, debido a su elevada densidad
bacteriana (7,39,42).
El perfil global de susceptibilidad antimicrobiana evidenció una elevada carga de resistencia fenotípica,
con patrones claramente dependientes del antibiótico evaluado, en concordancia con lo reportado en
enterococos de origen animal por diversos autores. Destacó la resistencia prácticamente generalizada a
rifampicina, linezolid y eritromicina, con porcentajes superiores al 96 %, así como los altos niveles
frente a amoxicilina y penicilina, que superaron el 86 % de los aislamientos. Estos perfiles han sido
asociados previamente a modificaciones en proteínas fijadoras de penicilina y a la adquisición de genes
móviles localizados en plásmidos y transposones (20,25,26,27). En este contexto, la resistencia
observada frente a vancomicina reviste relevancia epidemiológica. Si bien la mayoría de estudios
realizados en animales de compañía reportan una baja prevalencia de resistencia a glicopéptidos (31,37),
los hallazgos del presente estudio concuerdan con reportes aislados que documentan la circulación de
cepas portadoras de determinantes de resistencia en escenarios caracterizados por una mayor presión
antimicrobiana (11,22).
En contraste, norfloxacino, ciprofloxacino y minociclina mostraron una mayor proporción de
aislamientos clasificados como sensibles, aunque con presencia de categorías intermedias y resistentes.
pág. 5076
Este comportamiento es comparable al descrito en estudios previos, donde la respuesta de Enterococcus
spp. frente a fluoroquinolonas y tetraciclinas presenta una variabilidad considerable en función del
contexto geográfico y del historial de exposición antimicrobiana (20,25,26,27).
Un hallazgo relevante fue la identificación de multirresistencia antimicrobiana en el 100 % de los
aislamientos, definida como resistencia a tres o más familias de antibióticos. Este resultado confirma la
elevada capacidad adaptativa de Enterococcus spp. frente a la presión antimicrobiana y coincide con lo
descrito por Guardabassi et al. (11), quienes señalan a los enterococos como importantes reservorios de
genes de resistencia en poblaciones animales. Asimismo, la asociación significativa entre la resistencia
a ciprofloxacina y la permanencia de los animales en ambientes con condiciones higiénicas deficientes
sugiere que factores ambientales y de manejo influyen directamente en la selección y persistencia de
cepas resistentes (11,12,23,46).
En conjunto, los resultados se alinean con la evidencia internacional (7,11,18,27,41) que describe a
Enterococcus spp. como un microorganismo frecuente en la microbiota intestinal canina, con perfiles
de susceptibilidad antimicrobiana variables y refuerzan la necesidad de abordar estos hallazgos desde el
enfoque de Una Sola Salud, reconociendo la interconexión entre la salud animal, humana y ambiental
en la dinámica de la resistencia antimicrobiana.
CONCLUSIÓN
El presente estudio evidencia que Enterococcus spp. constituye un componente frecuente de la
microbiota rectal de perras clínicamente sanas, con una elevada prevalencia y un perfil de
susceptibilidad antimicrobiana caracterizado por altos niveles de resistencia y multirresistencia frente a
diversos antibióticos, lo que refleja la capacidad adaptativa de este género bacteriano.
Asimismo, se identificó una asociación significativa entre la resistencia a ciprofloxacina y condiciones
higiénicas deficientes, lo que resalta la influencia de factores ambientales en la selección y diseminación
de cepas resistentes. Estos hallazgos aportan información de línea base relevante y refuerzan la
importancia de la vigilancia antimicrobiana bajo un enfoque de Una Sola Salud.
pág. 5077
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