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EVALUACIÓN DE BIOPRODUCTOS
COMERCIALES EN LA BIORREMEDIACIÓN
EX SITU DE SUELOS CONTAMINADOS CON
DIÉSEL EN ECUADOR
IMPLEMENTATION OF A LIVING PHARMACY AND THE
DEVELOPMENT OF LIFE SKILLS: A SYSTEMATIC REVIEW
Doménica Estefanía Silva Carrasco
Universidad Estatal Península de Santa Elena - Facultad de Ciencias del Mar
Sonnya Patricia Mendoza Lombana
Universidad Estatal Península de Santa Elena - Facultad de Ciencias del Mar

pág. 882
DOI: https://doi.org/10.37811/cl_rcm.v10i3.24061
Evaluación de bioproductos comerciales en la biorremediación ex situ de
suelos contaminados con diésel en Ecuador
RESUMEN
Ecuador, como país productor de petróleo, ha sido afectado por derrames de hidrocarburos que impactan
negativamente la calidad de los suelos. El presente estudio evaluó la eficiencia de bioproductos
comerciales basados en bacterias, hongo, enzimas bacterianas y la combinación de estos en la
degradación de hidrocarburos totales de petróleo (TPH) en suelo limo-arcilloso contaminado con diésel,
bajo condiciones ex situ. El experimento se desarrolló durante 50 días en microcosmos con condiciones
controladas, utilizando un diseño experimental con cinco tratamientos y tres repeticiones, para un total
de 15 unidades experimentales. La cuantificación del porcentaje de degradación de T´H se realizó
mediante análisis espectrofotométrico. Los resultados mostraron diferencias en la eficiencia de los
tratamientos, siendo el tratamiento con hongo el que presentó el mayor porcentaje de degradación
(31.12%), seguido del tratamiento mixto (27.94%), enzimas bacterianas (26,08%) y bacterias (22,38%).
Se registró el crecimiento microbiano del suelo, identificándose bacterias del genero Bacillus y el hongo
Trichoderma sp. Los parámetros físico-químicos del suelo se mantuvieron estables durante el ensayo,
mientras que la materia orgánica y el carbono orgánico disminuyeron como resultado de la actividad
microbiana. Los resultados evidencian que los tratamientos biológicos ex situ representan una
alternativa eficiente, sostenible y ambientalmente amigable para la remediación de suelos contaminados
con diésel.
Palabras clave: Biorremediación; suelos contaminados; tratamiento ex situ; TPH; bioproductos
comerciales; Bacillus; Trichoderma sp.
1 Autor principal
Correspondencia: domessilva8@gmail.com
Doménica Estefanía Silva Carrasco1
domessilva8@gmail.com
https://orcid.org/0009-0004-3478-6782
Universidad Estatal Península de Santa Elena -
Facultad de Ciencias del Mar
Ecuador
Sonnya Patricia Mendoza Lombana
smendoza@upse.edu.ec
https://orcid.org/0000-0002-3283-9199
Universidad Estatal Península de Santa Elena -
Facultad de Ciencias del Mar
Ecuador

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Implementation of a Living Pharmacy and the Development of Life Skills: A
Systematic Review
ABSTRACT
Ecuador, as an oil-producing country, has been affected by hydrocarbon spills that negatively impact
soil quality. This study evaluated the efficiency of commercial bioproducts based on bacteria, fungi,
bacterial enzymes, and their combination in the degradation of total petroleum hydrocarbons (TPH) in
diesel-contaminated silty-clay soil under ex situ conditions. The experiment was conducted over 50 days
using controlled microcosms and an experimental design consisting of five treatments with three
replicates, for a total of 15 experimental units. The percentage of TPH degradation was quantified
through spectrophotometric analysis. The results showed differences in treatment efficiency, with the
fungal treatment presenting the highest degradation percentage (31.12%), followed by the mixed
treatment (27.94%), bacterial enzymes (26.08%), and bacteria (22.38%). Microbial growth in the soil
was observed, identifying bacteria belonging to the genus Bacillus and the fungus Trichoderma sp. Soil
physicochemical parameters remained stable throughout the experiment, while organic matter and
organic carbon decreased as a result of microbial activity. The findings demonstrate that ex situ
biological treatments represent an efficient, sustainable, and environmentally friendly alternative for the
remediation of diesel-contaminated soils.
Keywords: Bioremediation; contaminated soils; ex situ treatment; TPH; commercial bioproducts;
Bacillus; Trichoderma sp.
Artículo recibido 25 abril 2026
Aceptado para publicación: 25 mayo 2026

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INTRODUCCIÓN
La contaminación por hidrocarburos derivados del petróleo constituye una problemática ambiental
global debido a su impacto negativo sobre los ecosistemas, la salud humana y la estabilidad
socioambiental. En países petroleros como Ecuador, los derrames de crudo representan una fuente
recurrente de contaminación, asociados principalmente a fallas operativas, fugas en sistemas de
almacenamiento y deficiencias en el mantenimiento de oleoductos. La presencia de hidrocarburos totales
del petróleo (TPH) en el suelo es particularmente crítica debido a su compleja composición química
incluyendo alcanos, compuestos aromáticos, resinas y asfaltenos, su alta toxicidad y su persistencia en
el ambiente (Quispe, 2020).
Estos contaminantes alteran las propiedades fisicoquímicas del suelo, reducen su fertilidad, afectan la
actividad microbiana y favorecen procesos de lixiviación que pueden extender la contaminación hacia
aguas subterráneas y ecosistemas acuáticos. Además, presentan efectos mutagénicos, teratogénicos y
carcinogénicos en organismos vivos (Wang et al., 2017). Frente a esta problemática, la biorremediación
emerge como una alternativa sostenible y costo-efectiva en comparación con métodos físicos y
químicos, los cuales suelen ser más invasivos y generar contaminación secundaria.
La biorremediación aprovecha la capacidad metabólica de microorganismos para utilizar los
hidrocarburos como fuente de carbono y energía, facilitando su degradación. En este contexto, el uso de
bioproductos comerciales basados en bacterias, hongos y enzimas representa una estrategia prometedora
para acelerar estos procesos (Chen et al., 2015; Wang et al., 2017). Es una técnica limpia, no muy
costosa, accesible y en algunas ocasiones no requiere de sustancias adicionales, por su composición, ya
que se usan microrganismos para degradar a los compuestos contaminantes presentes, debido a que las
moléculas de los hidrocarburos resultan ser una excelente fuente de carbono y energía, lo que posibilita
el desarrollo de los microorganismos al metabolizar estos compuestos tóxicos (Abad, 2008).
En esta biorremediación experimental, se usó tres bioproductos que son altamente utilizados en la
industria acuícola y en la agricultura. El primer bioproducto: Terminate, que es una mezcla que contiene
cuatro tipos de bacterias liofilizadas del género Bacillus, este bioproducto es altamente utilizado en la
industria acuícola en el cultivo de camarones o peces. El segundo bioproducto Trichofull, es a base de
un microhongo del género Trichoderma sp., el cual es utilizado en la industria agrícola y por último

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Biobac A, un bioproducto a base de enzimas bacterianas y metabolitos utilizado mayormente en la
industria acuícola.
En las últimas décadas, múltiples investigadores han documentado y registrado el comportamiento
microbiano en la degradación de los hidrocarburos, dando excelentes resultados, como en el estudio
realizado por Arrieta et al., 2012, en la cual caracterizó un consorcio bacteriano integrado por los géneros
Flavobacterium sp. Sanguibacter soli, Staphylococcus aureus, Bacillus sp, Enterobacter sp, y
Arthorbacter sp, los cuales degradaron el diésel del suelo. Las especies de hongos como Favolus
tenuiculus y Trichoderma sp producen enzimas ligninolíticas, incluyendo lipasas, lacasas y peroxidasas,
las cuales descomponen compuestos complejos como los hidrocarburos aromáticos policíclicos (HAPs)
(Palacios Carlos & Silvia Llerena., 2024). Las enzimas, ya sean producidas por bacterias u hongos, son
fundamentales en el proceso de biorremediación (Peixoto, R. S., Vermelho, A. B., & Rosado, A. S.
2011).
Los suelos afectados por derrames de diésel se consideran como peligrosos para la vida microbiana y
vegetal, lo que los hace inadecuados, por lo que, la biorremediación mediante bacterias, hongos y
enzimas bacterianas se presenta como una opción sostenible y económicamente viable, capaz de
descomponer hidrocarburos complejos sin producir contaminación adicional (Peña Murillo et al., 2025).
En este estudio, el suelo presenta una concentración inicial de 2571 mg/kg y se plantea una reducción
de las concentraciones de cada tratamiento en un periodo de tiempo de 50 días, realizando una
biorremediación ex situ. Sin embargo, la implementación efectiva de estas nuevas biotecnologías en
nuestro país se ve limitada por la falta de protocolos estandarizados, capacitación técnica especializada
y estudios que optimicen el uso de microorganismos y sus enzimas para la biorremediación. Es necesario
fortalecer la investigación científica para aportar información que contribuya a lograr manejos más
amigables con el medio ambiente. El objetivo principal es analizar l la eficiencia de la biorremediación
de suelos contaminados con hidrocarburos mediante la aplicación individual de bacterias, hongos y
enzimas bacterianas de productos comerciales, determinando cuál de estos tratamientos presenta el
mayor porcentaje de biodegradación.

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METODOLOGÍA
Área de estudio
El estudio se desarrolló en el Megaterio de EP Petroecuador, ubicado en el cantón La Libertad, provincia
de Santa Elena, Ecuador (2°13′06″ S, 80°53′05″ W). El suelo utilizado correspondió a un material
previamente contaminado con diésel y almacenado en una biopila destinada a procesos de remediación.
Tipo de estudio
El enfoque de este proyecto fue experimental, cualitativo y cuantitativo, se identificó, que tratamiento
presentó el mayor porcentaje de reducción de hidrocarburos del suelo de manera experimentalmente ex
situ, de forma descriptiva y analítica. La técnica principal del análisis de suelo fue por equipos de
laboratorio para realizar la detección de TPH y se realizó los análisis microbiológicos respectivos. Se
controló variables críticas como fueron: las físicas, químicas y microbiológicas. Por lo que se
cumplieron fases de campo y laboratorio cumpliendo los protocolos adecuados.
Diseño experimental
Se empleó un diseño experimental completamente al azar bajo condiciones ex situ, con el objetivo de
evaluar la eficiencia de bioproductos comerciales en la degradación de hidrocarburos totales de petróleo
(TPH). Se establecieron cinco tratamientos: control sin aplicación de bioproductos (C), bacterias
(Bacillus sp.) (B), hongos (Trichoderma sp.) (H), enzimas bacterianas (E) y un tratamiento combinado
de bacterias, hongos y enzimas (M). Cada tratamiento contó con tres réplicas, para un total de 15
unidades experimentales.
Ilustración 1
Ensayo de Bioestimulación
Nota. Modelo del diseño experimental de cada tratamiento.

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Muestreo y caracterización del suelo
El muestreo se realizó a una profundidad de 0–30 cm, recolectándose un total de 90 kg de suelo
contaminado. Previo al montaje experimental, se caracterizaron las propiedades fisicoquímicas del
suelo, incluyendo pH, humedad, materia orgánica, textura y contenido inicial de TPH, utilizando
métodos estandarizados. El contenido de TPH fue determinado mediante análisis espectrofotométrico
en el Laboratorio de Restauración Ambiental de EP Petroecuador.
Montaje de microcosmos y aplicación de tratamientos
Para el ensayo experimental se distribuyeron 6 kg de suelo en bandejas de aluminio, las cuales fueron
asignadas aleatoriamente a cada tratamiento. Los bioproductos comerciales se aplicaron semanalmente
a una dosis de 5 mL por bandeja durante un periodo de 50 días. El suelo del tratamiento control fue
removido semanalmente sin adición de bioproductos. Durante el ensayo se mantuvieron condiciones
controladas de pH, temperatura y humedad.
Análisis microbiológicos
El crecimiento de la microbiota bacteriana y fúngica fue monitoreado cada 8 días mediante recuento de
unidades formadoras de colonias (UFC/g), utilizando agar TSA para bacterias y agar PDA para hongos.
La identificación microbiana se realizó mediante tinción de Gram para bacterias y tinción con azul de
lactofenol para hongos, complementándose con pruebas bioquímicas de catalasa.
Análisis de hidrocarburos totales de petróleo (TPH)
El contenido de TPH fue evaluado al inicio del experimento, durante el proceso y al finalizar el ensayo,
empleando análisis espectrofotométrico. La eficiencia de biodegradación se expresó como porcentaje
de reducción de TPH respecto a los valores iniciales.
Análisis estadístico
Los datos obtenidos fueron evaluados mediante pruebas de normalidad (Shapiro–Wilk) y homogeneidad
de varianzas (Levene). Para determinar diferencias significativas entre tratamientos se aplicó un análisis
de varianza de una vía (ANOVA), seguido de una prueba post hoc de Tukey, considerando un nivel de
significancia de p < 0,05. Todos los análisis estadísticos se realizaron utilizando el software MINITAB
versión 19.0.
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RESULTADOS Y DISCUSIÓN
La identificación morfológica de los microorganismos presentes en los tratamientos se realizaron
mediante observación microscópica. En las muestras correspondientes al tratamiento bacteriano se
observaron células bacilares compatibles con bacterias Gram positivas y Gram negativas, predominando
morfologías bacilares típicas del género Bacillus (Figura 2).
Ilustración 2
Microfotografías de bacterias aisladas del tratamiento bacteriano. (A) Células bacilares observadas
mediante tinción de Gram, con predominio de bacilos Gram positivos; (B) Detalle microscópico de
agrupaciones celulares compatibles con el género Bacillus. Aumento 1000×.
En el tratamiento fúngico se evidenciaron la presencia de hifas septadas, con abundante formación de
conidios y estructuras reproductivas características del género Trichoderma sp., confirmando la
viabilidad y actividad del bioproducto aplicado (Figura S2).
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Ilustración 3
Microfotografías del tratamiento fúngico.
A) B)
Nota. (A) Hifas septadas observadas mediante tinción con azul de lactofenol; (B) Estructuras conidiales características del
género Trichoderma sp. Aumento 400×.
La aplicación de los tratamientos biológicos produjo diferencias en la reducción de los hidrocarburos
totales de petróleo (TPH) en el suelo contaminado con diésel durante los 50 días de ensayo ex situ. El
tratamiento control presentó una reducción promedio del 5,02%, lo que evidencia una degradación
mínima asociada a procesos naturales del suelo.
Tabla 1
Porcentajes finales obtenidos de cada tratamiento experimental
Nota. Valores obtenidos de cada tratamiento experimental, en porcentajes promediados totales.

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Entre los tratamientos evaluados, el tratamiento con hongos (Trichoderma sp.) alcanzó el mayor
porcentaje promedio de reducción de TPH (31,12%), seguido del tratamiento combinado de bacterias,
hongos y enzimas (27,94%) y del tratamiento con enzimas bacterianas (26,08%). El tratamiento con
bacterias (Bacillus sp.) presentó la menor eficiencia entre los bioproductos evaluados, con una reducción
promedio del 22,38%.
Ilustración 4
Valores de TPH registrados durante la experimentación y prueba de tratamientos.
Nota. Letras iguales indican que no existe diferencias estadísticamente significativas según ANOVA de una vía y test posterior
de Tukey (p<0,05).
El análisis estadístico mostró diferencias significativas entre los tratamientos (ANOVA, p < 0,05). La
prueba post hoc de Tukey indicó que el tratamiento con hongos presentó una eficiencia
significativamente mayor en la degradación de TPH en comparación con el control, mientras que los
tratamientos con enzimas y el tratamiento combinado mostraron valores intermedios de reducción.
Durante el ensayo se registró el crecimiento de la microbiota bacteriana y fúngica en los tratamientos
biológicos, observándose un incremento progresivo de las unidades formadoras de colonias (UFC/g) a
lo largo del tiempo. La identificación microscópica permitió confirmar la presencia de bacterias del
género Bacillus y del hongo Trichoderma sp., evidenciando su adaptación al suelo contaminado y su
participación activa en el proceso de biodegradación.
pág. 891
Ilustración 5
Curva de distribución de la carga bacteriana de cada tratamiento.
Nota. La línea azul indica una carga bacteriana baja en relación con la línea verde con un alto valor de la carga bacteriana.
Los parámetros fisicoquímicos del suelo, incluyendo pH, temperatura, humedad y conductividad
eléctrica, se mantuvieron relativamente estables durante el experimento. En contraste, la materia
orgánica y el carbono orgánico mostraron una disminución progresiva, asociada a la actividad
metabólica de los microorganismos durante la degradación del diésel.
pág. 892
Ilustración 6
Valores de temperatura, humedad, pH y materia orgánica registrados durante la experimentación y prueba de tratamientos.

pág. 893
Los resultados obtenidos en el presente estudio evidencian que el suelo contaminado con diésel presentó
condiciones fisicoquímicas adecuadas para la aplicación de un tratamiento de biorremediación ex situ.
La textura limo-arcillosa, junto con la estabilidad del pH, la temperatura y la conductividad eléctrica,
favoreció la adaptación, el crecimiento y la actividad metabólica de los microorganismos aplicados. La
elevada concentración inicial de materia orgánica y carbono orgánico se asoció directamente con la
presencia de hidrocarburos, los cuales fueron utilizados como fuente de carbono durante el proceso de
biodegradación.
La reducción de los hidrocarburos totales de petróleo (TPH) mostró diferencias significativas entre los
tratamientos evaluados, destacándose el tratamiento con Trichoderma sp., que alcanzó la mayor
eficiencia de degradación (31,12%), seguido del tratamiento combinado de bacterias, hongos y enzimas
(27,94%), las enzimas bacterianas (26,08%) y las bacterias (Bacillus sp.) con un 22,38%. Estos
resultados concuerdan con el análisis de varianza, el cual evidenció diferencias estadísticamente
significativas en la degradación de TPH, mientras que los parámetros fisicoquímicos permanecieron
estables.
La eficiencia observada en los tratamientos bacterianos puede explicarse por la capacidad metabólica
de especies del género Bacillus para utilizar hidrocarburos como fuente de carbono y energía, así como
por su producción de biosurfactantes y enzimas degradativas, características ampliamente reportadas en
la literatura (Sakthipriya et al., 2015; Vizuete-García, 2020). Estudios previos han demostrado la
diversidad y adaptabilidad de bacterias degradadoras de hidrocarburos en suelos contaminados, lo cual
respalda la respuesta observada en el presente trabajo (Chaillan et al., 2004; Tourova et al., 2016, 2018).
Por otro lado, la mayor eficiencia del tratamiento fúngico se atribuye a la elevada capacidad adaptativa
de Trichoderma sp., su rápida colonización del sustrato y su habilidad para secretar enzimas
extracelulares oxidativas capaces de degradar compuestos complejos, incluidos hidrocarburos
aromáticos policíclicos (HAP). Estos hallazgos coinciden con lo reportado por Castro y Rivillas (2012)
y Daccò et al. (2020) quienes destacan el potencial del género Trichoderma en procesos de
biorremediación de ambientes contaminados con hidrocarburos.
Si bien el tratamiento combinado de bacterias, hongos y enzimas presentó una reducción significativa
de TPH, su eficiencia fue inferior al tratamiento fúngico individual. Este comportamiento sugiere que

pág. 894
la interacción microbiana no siempre genera efectos sinérgicos inmediatos, dependiendo del tipo de
contaminante, del sustrato y de la dinámica competitiva entre microorganismos, tal como lo indican Ule
(2021) y Cañar (2025). No obstante, estudios como el de Dai et al. (2020) demuestran que los sistemas
combinados pueden alcanzar mayores eficiencias en periodos de tratamiento más prolongados.
En general, los resultados confirman que el control de las condiciones fisicoquímicas en sistemas ex situ
contribuye significativamente a la estabilidad del proceso y a la eficiencia de biodegradación en periodos
cortos de tiempo, coincidiendo con lo reportado por Muñoz (2016). Asimismo, la correlación positiva
entre el crecimiento microbiano y los parámetros del suelo evidencia que la biodegradación está
estrechamente ligada a la adaptación y actividad metabólica de los microorganismos en el medio
contaminado.
Finalmente, aunque el presente estudio demuestra el alto potencial de Trichoderma sp. y Bacillus sp. en
la biorremediación de suelos contaminados con diésel, se recomienda profundizar en estudios
moleculares y bioquímicos que permitan comprender con mayor detalle las rutas metabólicas
involucradas y optimizar futuras aplicaciones a escala ambiental.
CONCLUSIONES
El presente estudio demostró que la biorremediación ex situ mediante el uso de bioproductos
comerciales constituye una alternativa efectiva para la reducción de hidrocarburos totales del petróleo
(TPH) en suelos contaminados con diésel, bajo condiciones controladas. En un periodo experimental de
50 días, todos los tratamientos evaluados lograron reducciones significativas de TPH, alcanzando una
degradación cercana al 30%, lo que evidencia su capacidad para potenciar los procesos naturales de
biodegradación.
El tratamiento con Trichoderma sp. presentó la mayor eficiencia de degradación (31,12%), seguido del
tratamiento combinado de bacterias, hongos y enzimas (27,94%), enzimas bacterianas (26,08%) y
bacterias (Bacillus sp.) con 22,38%. Estas diferencias indican que la eficiencia del proceso depende
principalmente de la composición microbiana de los bioproductos aplicados, mientras que los
parámetros fisicoquímicos del suelo (pH, temperatura, humedad y conductividad eléctrica), al
mantenerse estables, favorecieron la actividad microbiana sin influir de forma directa en la magnitud de
la reducción de TPH.

pág. 895
Asimismo, se observó un incremento de la microbiota bacteriana y fúngica en todos los tratamientos, lo
que confirma la adaptación y activación metabólica de los microorganismos frente a la disponibilidad
de hidrocarburos como fuente de carbono. En conjunto, los resultados resaltan la importancia del control
de las condiciones ex situ para lograr una biorremediación eficiente en periodos relativamente cortos.
Para finalizar, los bioproductos microbianos comerciales evaluados presentan un alto potencial para ser
integrados en programas de gestión ambiental y recuperación de suelos contaminados con
hidrocarburos, ofreciendo una alternativa sostenible y ambientalmente amigable para la remediación de
ecosistemas degradados.
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