Regresión lineal para sars-cov-2 en aguas residuales y la dinámica infecciosa de covid-19 en el baix llobregat, España

Palabras clave: covid-19, pandemic dynamic, time series, environment epidemiology

Resumen

La detección del ARN del SARS-CoV-2 en las aguas residuales es útil para identificar la presencia del COVID-19 en la comunidad. Este método proporciona información adicional, barata e indicativa del contagio de COVID-19.  La presente investigación estudia el caso del Baix Llobregat en Cataluña, España. Métodos: Esta investigación utilizó un conjunto de datos abiertos de la "Generalitat de Cataluña" para el Baix Llobregat. Se analizaron las series temporales de la dinámica de COVID-19 y de los genes de COVID-19 en las aguas residuales para 2020-2022.  Se realizó una regresión lineal simple y múltiple para las variables Genes N1 y N2 en aguas residuales y los indicadores epidemiológicos de COVID-19. Se utilizó un valor p<0,05 para los análisis estadísticos. Resultados: La regresión lineal entre los genes N1 y N2 de COVID-19 muestra una alta correlación para 2020 y 2021. La variable con mejor correlación para el gen N1 fue la incidencia acumulada y la mejor variable asociativa para el gen N2 fue el %PCR-RAT positivo. En la regresión lineal múltiple, el modelo resulta aceptable al considerar el ARN SARS-CoV-2 y los indicadores epidemiológicos más altos con valores significativos (p<0,05). Discusión: La presencia de COVID-19 en aguas residuales podría ser útil para determinar la dinámica de COVID-19 en la comunidad. En este estudio, la incidencia acumulada y el PCR-RAT% positivo mostraron un alto rendimiento en la regresión lineal. Los resultados gráficos revelan tendencias similares con los genes de COVID-19 en los residuos del agua y las tasas epidemiológicas para las series temporales

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Citas

Bivins, A., North, D., Ahmad, A., Ahmed, W., Alm, E., Been, F., Bhattacharya, P., Bijlsma, L., Boehm, A. B., Brown, J., Buttiglieri, G., Calabro, V., Carducci, A., Castiglioni, S., Cetecioglu Gurol, Z., Chakraborty, S., Costa, F., Curcio, S., De Los Reyes, F. L., … Bibby, K. (2020). Wastewater-Based Epidemiology: Global Collaborative to Maximize Contributions in the Fight against COVID-19. Environmental Science and Technology, 54(13), 7754–7757. https://doi.org/10.1021/ACS.EST.0C02388/ASSET/IMAGES/LARGE/ES0C02388_0001.JPEG

Chen, Y., Chen, L., Deng, Q., Zhang, G., Wu, K., Ni, L., Yang, Y., Liu, B., Wang, W., Wei, C., Yang, J., Ye, G., & Cheng, Z. (2020). The presence of SARS-CoV-2 RNA in the feces of COVID-19 patients. Journal of Medical Virology, 92(7), 833–840. https://doi.org/10.1002/JMV.25825

Dades COVID. (n.d.). Retrieved July 18, 2022, from https://dadescovid.cat/

Ellis, P., Somogyvári, F., Virok, D. P., Noseda, M., & McLean, G. R. (2021). Decoding Covid-19 with the SARS-CoV-2 Genome. Current Genetic Medicine Reports 2021 9:1, 9(1), 1–12. https://doi.org/10.1007/S40142-020-00197-5

Gonzalez, R., Curtis, K., Bivins, A., Bibby, K., Weir, M. H., Yetka, K., Thompson, H., Keeling, D., Mitchell, J., & Gonzalez, D. (2020). COVID-19 surveillance in Southeastern Virginia using wastewater-based epidemiology. Water Research, 186, 116296. https://doi.org/10.1016/J.WATRES.2020.116296

Hu, B., Guo, H., Zhou, P., & Shi, Z.-L. (2021). Characteristics of SARS-CoV-2 and COVID-19. Nature Reviews Microbiology, 19(3), 141–154. https://doi.org/10.1038/s41579-020-00459-7

Idescat. El municipio en cifras. Martorell (Baix Llobregat). (n.d.). Retrieved July 15, 2022, from https://www.idescat.cat/emex/?id=081141&lang=es

Idescat. The municipality in figures. Sant Feliu de Llobregat (Baix Llobregat). (n.d.). Retrieved July 15, 2022, from https://www.idescat.cat/emex/?id=082114&lang=en

Koureas, M., Amoutzias, G. D., Vontas, A., Kyritsi, M., Pinaka, O., Papakonstantinou, A., Dadouli, K., Hatzinikou, M., Koutsolioutsou, A., Mouchtouri, V. A., Speletas, M., Tsiodras, S., & Hadjichristodoulou, C. (2021). Wastewater monitoring as a supplementary surveillance tool for capturing SARS-COV-2 community spread. A case study in two Greek municipalities. Environmental Research, 200, 111749. https://doi.org/10.1016/J.ENVRES.2021.111749

Larsen, D. A., & Wigginton, K. R. (2020). Tracking COVID-19 with wastewater. Nature Biotechnology, 38(10), 1151. https://doi.org/10.1038/S41587-020-0690-1

McMahan, C. S., Self, S., Rennert, L., Kalbaugh, C., Kriebel, D., Graves, D., Colby, C., Deaver, J. A., Popat, S. C., Karanfil, T., & Freedman, D. L. (2021). COVID-19 wastewater epidemiology: a model to estimate infected populations. The Lancet Planetary Health, 5(12), e874–e881. https://doi.org/10.1016/S2542-5196(21)00230-8/ATTACHMENT/D719E632-85E0-46C2-A1A4-10D3C1118991/MMC1.PDF

Petala, M., Kostoglou, M., Karapantsios, T., Dovas, C. I., Lytras, T., Paraskevis, D., Roilides, E., Koutsolioutsou-Benaki, A., Panagiotakopoulos, G., Sypsa, V., Metallidis, S., Papa, A., Stylianidis, E., Papadopoulos, A., Tsiodras, S., & Papaioannou, N. (2022). Relating SARS-CoV-2 shedding rate in wastewater to daily positive tests data: A consistent model based approach. The Science of the Total Environment, 807(Pt 2). https://doi.org/10.1016/J.SCITOTENV.2021.150838

Vallejo, J. A., Trigo-Tasende, N., Rumbo-Feal, S., Conde-Pérez, K., López-Oriona, Á., Barbeito, I., Vaamonde, M., Tarrío-Saavedra, J., Reif, R., Ladra, S., Rodiño-Janeiro, B. K., Nasser-Ali, M., Cid, Á., Veiga, M., Acevedo, A., Lamora, C., Bou, G., Cao, R., & Poza, M. (2022). Modeling the number of people infected with SARS-COV-2 from wastewater viral load in Northwest Spain. Science of The Total Environment, 811, 152334. https://doi.org/10.1016/J.SCITOTENV.2021.152334

Zhang, W., Du, R. H., Li, B., Zheng, X. S., Yang, X. Lou, Hu, B., Wang, Y. Y., Xiao, G. F., Yan, B., Shi, Z. L., & Zhou, P. (2020). Molecular and serological investigation of 2019-nCoV infected patients: implication of multiple shedding routes. Emerging Microbes & Infections, 9(1), 386. https://doi.org/10.1080/22221751.2020.1729071

Zhou, P., Yang, X.-L., Wang, X.-G., Hu, B., Zhang, L., Zhang, W., Si, H.-R., Zhu, Y., Li, B., Huang, C.-L., Chen, H.-D., Chen, J., Luo, Y., Guo, H., Jiang, R.-D., Liu, M.-Q., Chen, Y., Shen, X.-R., Wang, X., … Shi, Z.-L. (2020). A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature, 579(7798), 270–273. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7

Publicado
2022-11-14
Cómo citar
Ayala-Aldana, N., Monleon-Getino, A., & Canela-Soler, J. (2022). Regresión lineal para sars-cov-2 en aguas residuales y la dinámica infecciosa de covid-19 en el baix llobregat, España. Ciencia Latina Revista Científica Multidisciplinar, 6(6), 250-261. https://doi.org/10.37811/cl_rcm.v6i6.3486
Sección
Artículos