Caracterización molecular de la cañihua (chenopodium Pallidicaule aellen)

usando marcadores moleculares issr (inter simple sequence repeats)

Palabras clave: cañihua, chenopodium pallidicaule, issr, marcadores moleculares, CTAB

Resumen

Se realizó una estandarización del método de extracción de ADN para cañihua (Chenopodium pallidicaule Aellen) y la caracterización molecular mediante marcadores moleculares ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Se utilizaron hojas de 40 accesiones de cañihua tomadas del banco de germoplasma del Programa de Cereales y Granos Nativos de la UNALM provenientes de dos provincias de Puno. Se realizó la extracción del ADN mediante el método CTAB. La agregación de cloroformo: alcohol isoamílico (24:1) y del etanol 96% permitieron la extracción de ADN de buena calidad. Obtenido el ADN, se realizó la amplificación PCR, PAGE y tinción con nitrato de plata. Se evaluó el porcentaje de loci polimórficos, contenido de información polimórfica y análisis de variancia molecular. Se seleccionaron 7 cebadores que produjeron 52 locus polimórficos de 144 marcadores ISSR, siendo los más informativos 841, 812, 810, 834 y BOR2. Una alta diferenciación genética entre poblaciones fue detectada basada en el AMOVA (Fst = 0.1544). Esto hace suponer que, la posición geográfica marca la diferenciación genética entre poblaciones de diferentes provincias.

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.

Citas

Alcázar, P. G. G. (2019). Diversidad genética de la colección de Opuntia ficus indica “tuna” del INIA. Investigación, 27(1), 93-98.

Arnillas, C., Carranza, C., Mesones, C., Moretti, M., & Bueno, O. (2017). Plan estratégico de la cañihua (Doctoral dissertation, Pontificia Universidad Catolica del Peru-CENTRUM Catolica (Peru)).

Astarini I., Plummer J., Lancaster R. & Yan G. 2006. Genetic diversity of Indonesian cauliflower cultivars and their relationships with hybrid cultivars grown in Australia. Scientia Horticulturae 108: 143-150.

Bednarskaya, I. A., Popov, V. N., Dugar, Y. N., Akinina, G. E., & Dolgova, T. A. (2014). ISSR analysis of some species of Angustifoliate Fescue. Cytology and genetics, 48(6), 364-370.

Castañeda-Cardona, C. C., Portela-Puerta, R., & Morillo-Coronado, Y. (2021). Caracterización molecular con marcadores ISSR de la colección de cítricos de la Universidad de los Llanos. Revista de Investigación Agraria y Ambiental, 12(2), 67-84.

da Silva, B. M., Rossi, A. A. B., Dardengo, J. D. F. E., de Araujo, V. A. A. C., Rossi, F. S., de Oliveira, L. O., & Clarindo, W. R. (2016). Genetic diversity estimated using inter-simple sequence repeat markers in commercial crops of cupuassu tree. Ciência Rural, 46(1), 108.

Doyle J. and Doyle J. 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochem Bull 19: 11-15.

Jiménez, J. 2006. Biodiversity of traditional seed propagated crops cultivated in Peruvian highland. Departments of Genetics UNIVERSITY of SILESIA.

Jin, Z., Li, J. 2007. Genetic differentiation in endangered Heptacodium miconioides Rehd. based on ISSR polymorphism and implications for its conservation. Forest Ecology and Management 245: 130-136

Kashinskaya, E. N., Andree, K. B., Simonov, E. P., & Solovyev, M. M. (2017). DNA extraction protocols may influence biodiversity detected in the intestinal microbiome: a case study from wild Prussian carp, Carassius gibelio. FEMS microbiology ecology, 93(2), fiw240.

Mayta Anco, M. E. (2016). Dosimetría de rayos gamma para la inducción de mutación en cañihua (Chenopodium pallidicaule Aellen).

Morales Segovia, J. M. (2019). Expresión génica de flavanona 3-hidroxilasa y p-cumaril ester 3-hidroxilasa en el fruto de Solanum caripense Dunal mediante RT-PCR y RT-qPCR.

Nei, M. (1973). Analysis of gene diversity in subdivided populations. Proceedings of the national academy of sciences, 70(12), 3321-3323.

Pineda, N. F., Marin-Suarez, J., Forero-Ulloa, F. E., & Gómez-Palacio, A. (2021). Extracción de ADN bacteriano a partir de cuerpos de agua de uso agrícola. Ciencia y Agricultura, 18(1), 36-45.

Quispe, J. P. C. (2018). Procedimiento para elaborar chorizos de pollo, fortificado con proteína de Quinua (Chenopodium quinoa): Jhuly Paola Chiri Quispe. Revista Estudiantil AGRO-VET, 2(2), 242-254.

Roca Infante, L. A. (2015). Análisis de la diversidad genética de papas nativas de la zona suroeste del departamento de Junín mediante el uso de marcadores moleculares microsatélites.

Rohlf, J. 2004. Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System. Exeter Software, NY.

Rosales Espinoza, E. (2013). Caracterización molecular de la cañihua (Chenopodium pallidicaule Aellen) usando marcadores (No. F30. R68-T). Universidad Nacional Agraria La Molina, Lima (Perú).

Tamayo Contreras, H. L. (2010). Caracterización molecular inter e intra genotípica de 16 accesiones de Chenopodium quinoa (quinua) mediante la técnica de ISSR.

Toapanta Sánchez, I. D. P. (2016). Duración de las etapas fenológicas y profundidad radicular del cultivo de quinua (Chenopodium quinoa), var. Tunkahuán en el sector Querochaca, catón Cevallos, provincia Tungurahua (Bachelor's thesis).

Torreblanca, N. N. (2015). La quinua (Chenopodium quinoa Willd.) Alternativa de seguridad alimentaria para zonas desérticas. Ciencia & Desarrollo, (19), 19-24.

Vilches, C., Pradenas, J., Quiñones, A., & Brante, A. (2012). Asociación de Crepidula coquimbensis con Pagurus edwardsi: efecto sobre el potencial de dispersión y diferenciación genético poblacional. Revista de biología marina y oceanografía, 47(2), 327-331.

Zhang, L.; Wang, B.; Pan, L.; Peng, J. 2013. Recycling isolation of plant DNA, a novel method. Journal of Genetics and Genomics 40: 45 - 53.

Zúñiga Quispe, C. (2014). Efecto de la temperatura expandido sobre la concentración de aminoácidos esenciales en granos de amaranthus caudatus (kiwicha), variedad oscar blanco.

Publicado
2022-12-26
Cómo citar
Rosales-Espinoza, E., Jimenez-Dávalos, J., Sota-Cano , A. F., & Cáceres-Vizarreta , A. I. (2022). Caracterización molecular de la cañihua (chenopodium Pallidicaule aellen): usando marcadores moleculares issr (inter simple sequence repeats). Ciencia Latina Revista Científica Multidisciplinar, 6(6), 9149-9165. https://doi.org/10.37811/cl_rcm.v6i6.4063
Sección
Artículos