Caracterización metagenómica de cepas resistentes a agentes químicos y su utilidad probiótica contra vibrios parahaemolyticus
Resumen
La acuicultura sufre importantes pérdidas económicas en los cultivos de camarón blanco (Litopenaeus vannamei) debido a enfermedades de origen microbiano y viral, actualmente las enfermedades provocadas por bacterias del género Vibrio han tomado impulso en los sistemas de cultivo de camarón, y para combatirlo el uso de fármacos ha generado resistencia y enfermedades. El objetivo de esta investigación fue estudiar la caracterización metagenómica del microbiota expuesto a agentes químicos y comprobar la sensibilidad y utilidad probiótica contra vibrios parahaemolyticus en camarón blanco (Litopenaeus vannamei). Las muestras se recolectaron de reservorios de agua de mar tratada con ozono, las cuales fueron sembradas en agares generales y específicos, como agar Trypticasa soya (TSA); Chromagar bacillus (CB) y Man Rugosa Shamr (MRS) para luego iniciar el proceso de selección incubándose por 24 horas a 32°C. Se obtuvieron 2 consorcios bacterianos denominándolos CN5, RS3 y una colonia formadora de biopelícula denominándola CINV. Para el análisis de las muestras, se utilizó el protocolo otorgado por Ilumina para la preparación de librerías en la secuenciación metagenómica 16S, seguidamente realizando la evaluación de la actividad antagónica por la técnica de Kirby - Bauer Los resultados que se obtuvieron en este estudio indican que se identificaron una microbiota rica y compleja identificándose solo el 8,7% a nivel de especie con una abundancia del 100% de Bacillus sp, mientras que para la muestra CINV hubo una abundancia de 99% de vibrios no presentes en la base de datos de secuenciación. Las pruebas de inhibición in vitro muestran que la combinación de ambos consorcios microbianos tuvo un 99% de porcentaje de inhibición contra V. parahaemolyticus y CINV. Esta investigación servirá como línea base de estudio de bacterias salvajes con capacidad antimicrobiana, siendo una ventaja a diferencia de varios estudios en los que se realizan investigaciones a partir de esponjas marinas, corales donde se presentan limitaciones en cuanto a la disponibilidad de estos organismos.
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